本篇超大雷《仁王1+2》慎入！有許多玩家只玩過二代，對一代故事不熟，這段整理《仁王1》故事要點，供只玩過《仁王2》但沒時間去玩一代的玩家做補完。
「從此之後，不會再因靈石產生紛爭。」
明智光秀當初是如此認為，他為了顧大局背叛織田信長，將織田信長旗下大量靈石交給部下齋藤利三保管，以免靈石被世人濫用，想不到靈石仍在日本亂竄，甚至擴展到全世界，後續是《仁王1》的故事了。
《仁王1》主角是英國的航海家「威廉‧亞當斯」，他是日本第一位白人武士，德川家康賜予他「三浦按針」之名，是歷史上真實存在的人物，《仁王1》以此為設置進行改編。《仁王1》的故事發生在《仁王2》主角秀千代打敗果心居士將自己連同果心封印後，到最後一章威廉將秀千代封印解之間。
《仁王1》的故事時代是德川幕府時期，當時是西元1600多年，歐洲正值地理大發現的海權時代，歐洲各國爭先恐後向海外探險擴展領土。英國曾經利用精華的力量擊敗西班牙，但兩國仍在互相競爭。英國無奈國內精華已開採殆盡，覬覦日本豐富的精華資源，派出鍊金術士「凱瑞」前往日本；西班牙基於同樣的理由，派出密使「瑪麗亞」，這兩位抵達日本後，到觸搧風點火引發戰亂，暗中搜集精華。
威廉在《仁王1》故事中，小時後歷經波折，生活相當辛苦，守護靈「瑟夏」出現並守護著他，對威廉來說瑟夏是很重要的家人。瑟夏源自愛爾蘭語，為「自由」之意，她具備掌握精華與靈魂的能力，能讓威廉死而復生。凱瑞在故事開頭將瑟夏搶走，做為探索精華的工具，威廉為了奪回瑟夏，追著凱瑞遠洋渡海來到日本。
威廉到日本後，因具備靈性的體質，讓日本當地的守護靈附體後，透過守護靈的力量得以聽懂當地的語言，威廉在被守護靈附身前是聽不懂日文的，這設置出現在官方漫畫。附帶一提，凱瑞也不會講日文，他是利用瑟夏的精華能力進行語言翻譯。
威廉打敗第一個BOSS怨靈鬼後巧遇服部半藏(本名：服部正就)，半藏欣賞威廉斬妖除魔的能力，威廉則是要在他鄉異地尋找凱瑞，兩人達成協議互相合作，加入半藏所屬的德川勢力，認識了半藏的部下女忍者阿勝。
※《仁王2》的服部半藏本名為服部正成，正成是正就的父親。跟秀千代組隊的是父親正成，二代片尾威廉家出現的是兒子正就。
阿勝是德川家康妻子「築山殿」的私生女，德川家康曾經為了與織田信長打好關係，下令傳出不義醜聞的兒子德川信忠切腹自殺。德川信忠是阿勝的哥哥，阿勝小時後目睹信忠切腹的過程，故對武士十分厭惡，認為德川家康是為了權勢連家人都能放棄的卑鄙小人。
阿勝在故事中期被凱瑞夾為人質威脅德川家康，德川家康毫不猶豫捨棄部下阿勝令凱瑞相當錯愕，但家康捨棄家人並不是貪生怕死，家康認為戰爭必有犧牲，總需要有人來做這些殘酷的取捨，做出犧牲才能取得贏得戰爭，贏得戰爭才能平天下，平天下才能為人民帶來幸福。
阿勝原本就身為家康的忍者，早有為主赴死的覺悟，但威廉無法接受日本人動不動就要去死的觀念，畢竟威廉小時候生活很困苦，他認為人死了就什麼都沒了。威廉成功救下阿勝，兩人似乎產生了些感情，在《仁王1》的故事中沒有後續交待。
事後，凱瑞繼續利用靈石到處作亂，他還想復活織田信長，沒料到信長復活後不受控制，完全不甩凱瑞，跟威廉打上一架消遣後就自己返回陰間去了。凱瑞最後只好消耗大量精華召喚八歧大蛇，但仍被威廉擊敗殺死，威廉成功奪回瑟夏，搭船返回英國，阿勝目送著威廉的船離開。
威廉回到英國後，幹掉英國女王背後的幕後黑手「百目」，原先以為一切都結束了，但透過百目研究桌上的水晶球看見日本會繼續產發生戰亂，所以又再度搭船前往日本。
DLC1的故事以獨眼龍伊達政宗做開頭，西班牙密使瑪麗亞利用靈石的力量煽動伊達政宗，被威廉發現是幕後黑手，這是瑪麗亞在《仁王1》的關卡中首次登場。
DLC2的故事在講真田幸村，可以明顯感受出製作團隊將真田幸村碩造為第二主角。真田幸村屬於豐臣勢力，他的主君當時是豐臣秀賴，豐臣秀賴的父親是豐臣秀吉(藤吉郎)，母親是淺井茶茶。由於藤吉郎曾經妖化過，《仁王2》中半兵衛認為藤吉郎不可能擁有子嗣，《仁王1》故事中有提到豐臣秀賴是茶茶用靈石做出來的人造人。
※茶茶的父親是淺井長政，母親是阿市。
DLC3講述德川vs.豐臣，正史上真田幸村在該戰役「大阪之陣」中陣亡，《仁王1》改編成戰場上陣亡的幸村是他部下猿飛佐助假扮的替身，真正的真田幸村為了救主，跟威廉回到陷入大火的城堡找天子豐臣秀賴與茶茶。
豐臣秀賴雖然天身坐在天子的寶座，但他每天坐立難安，他認為全天下的人都覬覦他的權與錢，他恨透了世界。茶茶被《仁王2》封印解除時跑出來的玉藻前九尾妖狐附身，性格大變充滿魔性，又受到瑪麗亞煽動，最後化為妖狐被威廉與真田幸村阻止，阻止後瀕死的茶茶恢復人性，幸村決定侍奉茶茶到最後，兩人一同葬身火海，瑪麗亞則逃走下落不明。瑪麗亞會使一些奇怪的空間穿梭術式，被服部半藏稱為西班牙忍者。
接著回到《仁王2》最後章節的故事，瑪麗亞為了引發戰亂，想要復活惡名昭彰的暴君豐臣秀吉(藤吉郎)，復活儀式成功時果心居士出現，企圖再次搶走藤吉郎的身體，二代主角秀千代挺身抵擋反而被附身，只能在精神世界中抵抗果心居士(大岳丸)的侵蝕，藤吉郎醒來後發現秀千代化為妖開始爆走，心急如焚，利用靈石的力量好不容易再度救了秀千代。
藤吉郎一輩子風風雨雨，他用靈石逐夢卻付出慘痛的代價，得權勢不得子，得子得天下卻失去好友，尋回好友卻失去性命，最後終於與秀千代再見一面，心愿已了。藤吉郎對現世不再留戀，透過中陰之地走向彼岸，返回已死之人應去的歸屬。
秀千代與無明踏上永無止進的獵妖之旅；威廉跟阿勝結婚有了一個孩子；瑪麗亞被威廉逮捕，強制遣送回西班牙，完結灑花。
凱瑞跟瑪麗亞兩人都帶賽，凱瑞復活魔王織田信長，織田信長不鳥他；瑪麗亞復活暴君藤吉郎，結果藤吉郎是個好人，人算不如天算，出來混總是要還的。
以下是《仁王》故事中，各角色翻模的名人：
- 德川家康：市村正親。
- 豐臣秀吉：竹中直人。
- 阿勝：武井咲。
- 無明：波瑠。
